免疫共沉淀结合质谱技术蛋白互作
免疫共沉淀（co-inmunoprecipitation, Co-IP）技术是逐渐成为研究蛋白-蛋白间相互作用主要方法和手段，以细胞内源性靶蛋白为诱饵，将靶蛋白抗体与细胞总蛋白进行共孵育
CE-SDS纯度分析
使用CE (毛细管电泳仪) 对还原与非还原样品进行CE-SDS纯度分析，而后对主峰纯度进行积分。样品平行3针，当主峰纯度RSD≤5%时，报告平均值。
肽谱图（PMF）、肽指纹图谱、蛋白结构分析、二硫键、糖基化、磷酸化
肽图谱可以：1）证实一种蛋白质一级结构（氨基酸序列）包括其 N和C端，2）提供蛋白质修饰基团的位点和所占比例，如糖基化，乙酰化，硫酸盐化和磷酸化等。